Protein–RNA interactions for Protein: P12383

PDR1, Transcription factor PDR1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR1P12383 NPL3YDR432W 1245 nt13.03□□□□□ -0.32
PDR1P12383 PAM17YKR065C 594 nt13.03□□□□□ -0.32
PDR1P12383 VAR1Q0140 1197 nt13.02□□□□□ -0.33
PDR1P12383 DCW1YKL046C 1350 nt13.01□□□□□ -0.33
PDR1P12383 PAC11YDR488C 1602 nt13.01□□□□□ -0.33
PDR1P12383 YOL037CYOL037C 354 nt13□□□□□ -0.33
PDR1P12383 RPP2AYOL039W 321 nt13□□□□□ -0.33
PDR1P12383 TAT1YBR069C 1860 nt12.97□□□□□ -0.33
PDR1P12383 YOR139CYOR139C 393 nt12.97□□□□□ -0.33
PDR1P12383 SIS1YNL007C 1059 nt12.95□□□□□ -0.34
PDR1P12383 YDR509WYDR509W 348 nt12.92□□□□□ -0.34
PDR1P12383 REG2YBR050C 1017 nt12.91□□□□□ -0.34
PDR1P12383 YMR090WYMR090W 684 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR1P12383 PTP1YDL230W 1008 nt12.87□□□□□ -0.35
PDR1P12383 EMI2YDR516C 1503 nt12.87□□□□□ -0.35
PDR1P12383 CAC2YML102W 1407 nt12.81□□□□□ -0.36
PDR1P12383 ART5YGR068C 1761 nt12.78□□□□□ -0.36
PDR1P12383 YDL221WYDL221W 552 nt12.76□□□□□ -0.37
PDR1P12383 YJL152WYJL152W 360 nt12.76□□□□□ -0.37
PDR1P12383 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.75□□□□□ -0.37
PDR1P12383 NVJ2YPR091C 2313 nt12.74□□□□□ -0.37
PDR1P12383 PET9YBL030C 957 nt12.71□□□□□ -0.37
PDR1P12383 GFD2YCL036W 1701 nt12.71□□□□□ -0.38
PDR1P12383 YCH1YGR203W 447 nt12.7□□□□□ -0.38
PDR1P12383 TIR4YOR009W 1464 nt12.7□□□□□ -0.38
PDR1P12383 WHI5YOR083W 888 nt12.69□□□□□ -0.38
PDR1P12383 BUR6YER159C 429 nt12.67□□□□□ -0.38
PDR1P12383 YLR281CYLR281C 468 nt12.67□□□□□ -0.38
PDR1P12383 BMT5YIL096C 1011 nt12.65□□□□□ -0.38
PDR1P12383 RTS2YOR077W 699 nt12.63□□□□□ -0.39
PDR1P12383 YMR057CYMR057C 372 nt12.62□□□□□ -0.39
PDR1P12383 IRC15YPL017C 1500 nt12.61□□□□□ -0.39
PDR1P12383 YBR220CYBR220C 1683 nt12.61□□□□□ -0.39
PDR1P12383 SDH1YKL148C 1923 nt12.6□□□□□ -0.39
PDR1P12383 PUS2YGL063W 1113 nt12.56□□□□□ -0.4
PDR1P12383 Q0010Q0010 387 nt12.55□□□□□ -0.4
PDR1P12383 GIS3YLR094C 1509 nt12.55□□□□□ -0.4
PDR1P12383 SCC4YER147C 1875 nt12.55□□□□□ -0.4
PDR1P12383 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.53□□□□□ -0.4
PDR1P12383 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
PDR1P12383 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.5□□□□□ -0.41
PDR1P12383 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
PDR1P12383 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.5□□□□□ -0.41
PDR1P12383 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.5□□□□□ -0.41
PDR1P12383 RPM1RPM1 483 nt12.49□□□□□ -0.41
PDR1P12383 CUE1YMR264W 612 nt12.48□□□□□ -0.41
PDR1P12383 Q0144Q0144 330 nt12.46□□□□□ -0.41
PDR1P12383 IDH1YNL037C 1083 nt12.45□□□□□ -0.42
PDR1P12383 IMP2'YIL154C 1041 nt12.43□□□□□ -0.42
PDR1P12383 YIL100WYIL100W 354 nt12.42□□□□□ -0.42
PDR1P12383 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR1P12383 YLR236CYLR236C 324 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR1P12383 DSK2YMR276W 1122 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR1P12383 SEM1YDR363W-A 270 nt12.39□□□□□ -0.43
PDR1P12383 SRN2YLR119W 642 nt12.36□□□□□ -0.43
PDR1P12383 GBP2YCL011C 1284 nt12.36□□□□□ -0.43
PDR1P12383 YNL195CYNL195C 786 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR1P12383 YDR433WYDR433W 441 nt12.28□□□□□ -0.44
PDR1P12383 FRE6YLL051C 2139 nt12.28□□□□□ -0.44
PDR1P12383 ARA2YMR041C 1008 nt12.26□□□□□ -0.45
PDR1P12383 YSC84YHR016C 1407 nt12.25□□□□□ -0.45
PDR1P12383 FMP45YDL222C 930 nt12.24□□□□□ -0.45
PDR1P12383 SEC11YIR022W 504 nt12.24□□□□□ -0.45
PDR1P12383 TCD2YKL027W 1344 nt12.24□□□□□ -0.45
PDR1P12383 YPR011CYPR011C 981 nt12.24□□□□□ -0.45
PDR1P12383 PCH2YBR186W 1695 nt12.21□□□□□ -0.45
PDR1P12383 GUT2YIL155C 1950 nt12.18□□□□□ -0.46
PDR1P12383 RRT12YCR045C 1476 nt12.18□□□□□ -0.46
PDR1P12383 RRD1YIL153W 1182 nt12.14□□□□□ -0.47
PDR1P12383 LPX1YOR084W 1164 nt12.13□□□□□ -0.47
PDR1P12383 MXR2YCL033C 507 nt12.13□□□□□ -0.47
PDR1P12383 YHL050CYHL050C 2094 nt12.12□□□□□ -0.47
PDR1P12383 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR1P12383 ERV46YAL042W 1248 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR1P12383 YKR040CYKR040C 504 nt12.08□□□□□ -0.48
PDR1P12383 DED1YOR204W 1815 nt12.08□□□□□ -0.48
PDR1P12383 YLR122CYLR122C 378 nt12.07□□□□□ -0.48
PDR1P12383 FMP52YER004W 696 nt12.06□□□□□ -0.48
PDR1P12383 YCL042WYCL042W 360 nt12.02□□□□□ -0.49
PDR1P12383 ARP10YDR106W 855 nt12.01□□□□□ -0.49
PDR1P12383 PIB2YGL023C 1908 nt11.99□□□□□ -0.49
PDR1P12383 CWP1YKL096W 720 nt11.99□□□□□ -0.49
PDR1P12383 FMT1YBL013W 1206 nt11.98□□□□□ -0.49
PDR1P12383 YCR099CYCR099C 468 nt11.97□□□□□ -0.49
PDR1P12383 AI3Q0060 1248 nt11.95□□□□□ -0.5
PDR1P12383 Q0142Q0142 177 nt11.95□□□□□ -0.5
PDR1P12383 PCM1YEL058W 1674 nt11.94□□□□□ -0.5
PDR1P12383 ABZ2YMR289W 1125 nt11.94□□□□□ -0.5
PDR1P12383 ADH2YMR303C 1047 nt11.93□□□□□ -0.5
PDR1P12383 SNF6YHL025W 999 nt11.92□□□□□ -0.5
PDR1P12383 FRD1YEL047C 1413 nt11.89□□□□□ -0.51
PDR1P12383 SOR2YDL246C 1074 nt11.89□□□□□ -0.51
PDR1P12383 SOR1YJR159W 1074 nt11.89□□□□□ -0.51
PDR1P12383 MET8YBR213W 825 nt11.89□□□□□ -0.51
PDR1P12383 RTF1YGL244W 1677 nt11.88□□□□□ -0.51
PDR1P12383 BOP3YNL042W 1191 nt11.88□□□□□ -0.51
PDR1P12383 SIM1YIL123W 1431 nt11.85□□□□□ -0.51
PDR1P12383 UME6YDR207C 2511 nt11.84□□□□□ -0.51
PDR1P12383 SPP1YPL138C 1062 nt11.83□□□□□ -0.52
PDR1P12383 TOM20YGR082W 552 nt11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms