Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM13P0DJ93 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM13P0DJ93 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM13P0DJ93 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM13P0DJ93 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM13P0DJ93 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM13P0DJ93 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM13P0DJ93 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM13P0DJ93 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM13P0DJ93 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM13P0DJ93 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM13P0DJ93 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM13P0DJ93 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM13P0DJ93 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM13P0DJ93 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM13P0DJ93 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM13P0DJ93 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM13P0DJ93 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM13P0DJ93 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM13P0DJ93 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM13P0DJ93 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM13P0DJ93 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM13P0DJ93 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM13P0DJ93 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM13P0DJ93 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM13P0DJ93 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM13P0DJ93 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM13P0DJ93 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM13P0DJ93 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM13P0DJ93 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM13P0DJ93 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM13P0DJ93 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM13P0DJ93 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM13P0DJ93 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM13P0DJ93 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM13P0DJ93 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM13P0DJ93 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM13P0DJ93 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM13P0DJ93 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM13P0DJ93 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms