Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Csf1rP09581 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Csf1rP09581 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Csf1rP09581 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Csf1rP09581 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Csf1rP09581 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Csf1rP09581 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Csf1rP09581 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Csf1rP09581 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Csf1rP09581 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Csf1rP09581 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Csf1rP09581 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Csf1rP09581 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Csf1rP09581 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Csf1rP09581 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Csf1rP09581 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Csf1rP09581 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Csf1rP09581 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Csf1rP09581 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Csf1rP09581 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Csf1rP09581 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Csf1rP09581 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Csf1rP09581 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Csf1rP09581 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Csf1rP09581 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Csf1rP09581 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Csf1rP09581 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Csf1rP09581 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Csf1rP09581 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Csf1rP09581 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Csf1rP09581 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Csf1rP09581 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Csf1rP09581 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Csf1rP09581 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Csf1rP09581 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Csf1rP09581 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Csf1rP09581 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Csf1rP09581 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Csf1rP09581 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Csf1rP09581 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Csf1rP09581 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Csf1rP09581 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Csf1rP09581 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Csf1rP09581 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Csf1rP09581 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Csf1rP09581 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Csf1rP09581 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Csf1rP09581 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Csf1rP09581 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Csf1rP09581 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Csf1rP09581 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Csf1rP09581 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Csf1rP09581 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Csf1rP09581 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Csf1rP09581 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Csf1rP09581 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Csf1rP09581 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Csf1rP09581 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Csf1rP09581 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Csf1rP09581 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Csf1rP09581 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Csf1rP09581 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Csf1rP09581 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Csf1rP09581 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Csf1rP09581 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Csf1rP09581 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Csf1rP09581 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Csf1rP09581 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Csf1rP09581 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Csf1rP09581 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Csf1rP09581 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Csf1rP09581 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Csf1rP09581 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Csf1rP09581 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Csf1rP09581 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Csf1rP09581 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Csf1rP09581 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Csf1rP09581 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Csf1rP09581 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Csf1rP09581 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Csf1rP09581 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Csf1rP09581 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms