Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA5P08648 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA5P08648 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA5P08648 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA5P08648 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA5P08648 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA5P08648 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA5P08648 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA5P08648 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA5P08648 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA5P08648 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA5P08648 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA5P08648 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA5P08648 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA5P08648 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA5P08648 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA5P08648 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA5P08648 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA5P08648 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA5P08648 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA5P08648 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA5P08648 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA5P08648 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA5P08648 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA5P08648 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA5P08648 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA5P08648 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA5P08648 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA5P08648 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA5P08648 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA5P08648 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA5P08648 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA5P08648 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA5P08648 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA5P08648 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms