Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSN3P07498 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSN3P07498 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSN3P07498 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSN3P07498 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSN3P07498 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSN3P07498 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSN3P07498 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSN3P07498 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSN3P07498 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSN3P07498 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSN3P07498 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSN3P07498 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSN3P07498 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSN3P07498 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN3P07498 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN3P07498 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN3P07498 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSN3P07498 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSN3P07498 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSN3P07498 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSN3P07498 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSN3P07498 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSN3P07498 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSN3P07498 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSN3P07498 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSN3P07498 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSN3P07498 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSN3P07498 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSN3P07498 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSN3P07498 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSN3P07498 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSN3P07498 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSN3P07498 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSN3P07498 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSN3P07498 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSN3P07498 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSN3P07498 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSN3P07498 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSN3P07498 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSN3P07498 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSN3P07498 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSN3P07498 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSN3P07498 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSN3P07498 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSN3P07498 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSN3P07498 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSN3P07498 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSN3P07498 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSN3P07498 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSN3P07498 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSN3P07498 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSN3P07498 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSN3P07498 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSN3P07498 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSN3P07498 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSN3P07498 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSN3P07498 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSN3P07498 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSN3P07498 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSN3P07498 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSN3P07498 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSN3P07498 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSN3P07498 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSN3P07498 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSN3P07498 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSN3P07498 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSN3P07498 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSN3P07498 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSN3P07498 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSN3P07498 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSN3P07498 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSN3P07498 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSN3P07498 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSN3P07498 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSN3P07498 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSN3P07498 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSN3P07498 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSN3P07498 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSN3P07498 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSN3P07498 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSN3P07498 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSN3P07498 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSN3P07498 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSN3P07498 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSN3P07498 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSN3P07498 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSN3P07498 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSN3P07498 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSN3P07498 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN3P07498 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN3P07498 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN3P07498 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN3P07498 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN3P07498 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN3P07498 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN3P07498 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN3P07498 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSN3P07498 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSN3P07498 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.2 ms