Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCKP06239 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LCKP06239 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCKP06239 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCKP06239 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCKP06239 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCKP06239 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCKP06239 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCKP06239 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCKP06239 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCKP06239 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCKP06239 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCKP06239 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCKP06239 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCKP06239 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCKP06239 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCKP06239 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCKP06239 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCKP06239 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCKP06239 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCKP06239 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCKP06239 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCKP06239 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCKP06239 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCKP06239 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCKP06239 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCKP06239 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCKP06239 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCKP06239 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCKP06239 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCKP06239 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCKP06239 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCKP06239 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCKP06239 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCKP06239 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCKP06239 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCKP06239 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCKP06239 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCKP06239 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LCKP06239 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCKP06239 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCKP06239 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCKP06239 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCKP06239 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCKP06239 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCKP06239 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCKP06239 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LCKP06239 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCKP06239 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LCKP06239 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCKP06239 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCKP06239 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCKP06239 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCKP06239 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCKP06239 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCKP06239 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCKP06239 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCKP06239 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCKP06239 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCKP06239 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCKP06239 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCKP06239 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCKP06239 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCKP06239 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCKP06239 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCKP06239 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCKP06239 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCKP06239 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCKP06239 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCKP06239 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCKP06239 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCKP06239 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCKP06239 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCKP06239 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCKP06239 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCKP06239 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCKP06239 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCKP06239 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCKP06239 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCKP06239 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCKP06239 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCKP06239 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCKP06239 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCKP06239 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCKP06239 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCKP06239 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCKP06239 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LCKP06239 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCKP06239 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCKP06239 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCKP06239 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCKP06239 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCKP06239 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCKP06239 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCKP06239 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCKP06239 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCKP06239 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCKP06239 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCKP06239 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCKP06239 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms