Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3BP05452 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3BP05452 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3BP05452 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLEC3BP05452 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3BP05452 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3BP05452 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3BP05452 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3BP05452 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC3BP05452 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC3BP05452 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC3BP05452 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3BP05452 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3BP05452 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC3BP05452 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3BP05452 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC3BP05452 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC3BP05452 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC3BP05452 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC3BP05452 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC3BP05452 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC3BP05452 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC3BP05452 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC3BP05452 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC3BP05452 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC3BP05452 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC3BP05452 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC3BP05452 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC3BP05452 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLEC3BP05452 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC3BP05452 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC3BP05452 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC3BP05452 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC3BP05452 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC3BP05452 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC3BP05452 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC3BP05452 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC3BP05452 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC3BP05452 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC3BP05452 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLEC3BP05452 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC3BP05452 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC3BP05452 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC3BP05452 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLEC3BP05452 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLEC3BP05452 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLEC3BP05452 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLEC3BP05452 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLEC3BP05452 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC3BP05452 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms