Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNA6P05013 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNA6P05013 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNA6P05013 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNA6P05013 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNA6P05013 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNA6P05013 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNA6P05013 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNA6P05013 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNA6P05013 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNA6P05013 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA6P05013 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA6P05013 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNA6P05013 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNA6P05013 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNA6P05013 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNA6P05013 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNA6P05013 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNA6P05013 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNA6P05013 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNA6P05013 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA6P05013 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNA6P05013 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNA6P05013 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNA6P05013 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNA6P05013 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNA6P05013 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNA6P05013 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNA6P05013 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNA6P05013 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA6P05013 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNA6P05013 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNA6P05013 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA6P05013 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA6P05013 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA6P05013 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNA6P05013 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFNA6P05013 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNA6P05013 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNA6P05013 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA6P05013 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA6P05013 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA6P05013 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA6P05013 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA6P05013 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA6P05013 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNA6P05013 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNA6P05013 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA6P05013 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA6P05013 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA6P05013 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA6P05013 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA6P05013 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA6P05013 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA6P05013 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA6P05013 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA6P05013 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNA6P05013 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNA6P05013 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNA6P05013 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNA6P05013 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA6P05013 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA6P05013 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA6P05013 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNA6P05013 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA6P05013 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNA6P05013 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNA6P05013 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNA6P05013 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNA6P05013 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNA6P05013 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA6P05013 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA6P05013 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA6P05013 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA6P05013 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA6P05013 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNA6P05013 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNA6P05013 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNA6P05013 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA6P05013 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA6P05013 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNA6P05013 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA6P05013 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNA6P05013 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA6P05013 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA6P05013 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA6P05013 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA6P05013 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms