Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C9P02748 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C9P02748 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9P02748 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C9P02748 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9P02748 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9P02748 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9P02748 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9P02748 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9P02748 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9P02748 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9P02748 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9P02748 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9P02748 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9P02748 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9P02748 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9P02748 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9P02748 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9P02748 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9P02748 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C9P02748 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9P02748 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9P02748 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9P02748 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9P02748 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9P02748 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9P02748 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9P02748 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9P02748 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9P02748 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9P02748 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9P02748 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9P02748 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9P02748 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9P02748 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9P02748 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9P02748 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9P02748 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9P02748 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9P02748 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9P02748 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9P02748 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9P02748 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9P02748 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9P02748 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9P02748 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9P02748 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9P02748 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9P02748 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C9P02748 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C9P02748 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9P02748 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C9P02748 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9P02748 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9P02748 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9P02748 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9P02748 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9P02748 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9P02748 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9P02748 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9P02748 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9P02748 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9P02748 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9P02748 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9P02748 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C9P02748 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9P02748 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9P02748 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9P02748 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9P02748 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9P02748 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9P02748 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9P02748 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9P02748 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9P02748 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9P02748 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9P02748 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9P02748 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9P02748 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9P02748 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9P02748 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9P02748 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9P02748 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9P02748 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9P02748 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C9P02748 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9P02748 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9P02748 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
C9P02748 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9P02748 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9P02748 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9P02748 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9P02748 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9P02748 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C9P02748 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9P02748 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9P02748 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
C9P02748 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9P02748 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9P02748 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms