Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-DQA2P01906 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DQA2P01906 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DQA2P01906 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DQA2P01906 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DQA2P01906 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-DQA2P01906 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DQA2P01906 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DQA2P01906 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DQA2P01906 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DQA2P01906 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DQA2P01906 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DQA2P01906 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DQA2P01906 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DQA2P01906 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DQA2P01906 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DQA2P01906 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DQA2P01906 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DQA2P01906 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-DQA2P01906 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQA2P01906 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQA2P01906 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DQA2P01906 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DQA2P01906 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DQA2P01906 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DQA2P01906 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DQA2P01906 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DQA2P01906 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DQA2P01906 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DQA2P01906 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DQA2P01906 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQA2P01906 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQA2P01906 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DQA2P01906 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HLA-DQA2P01906 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DQA2P01906 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DQA2P01906 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DQA2P01906 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DQA2P01906 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DQA2P01906 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DQA2P01906 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DQA2P01906 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQA2P01906 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DQA2P01906 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DQA2P01906 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQA2P01906 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQA2P01906 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DQA2P01906 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DQA2P01906 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQA2P01906 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQA2P01906 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DQA2P01906 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQA2P01906 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms