Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHV2-5P01817 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHV2-5P01817 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHV2-5P01817 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGHV2-5P01817 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHV2-5P01817 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV2-5P01817 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV2-5P01817 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHV2-5P01817 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHV2-5P01817 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHV2-5P01817 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV2-5P01817 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHV2-5P01817 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHV2-5P01817 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHV2-5P01817 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHV2-5P01817 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV2-5P01817 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV2-5P01817 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV2-5P01817 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV2-5P01817 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGHV2-5P01817 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHV2-5P01817 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHV2-5P01817 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHV2-5P01817 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGHV2-5P01817 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGHV2-5P01817 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHV2-5P01817 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHV2-5P01817 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHV2-5P01817 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHV2-5P01817 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHV2-5P01817 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHV2-5P01817 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGHV2-5P01817 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHV2-5P01817 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHV2-5P01817 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV2-5P01817 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHV2-5P01817 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHV2-5P01817 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGHV2-5P01817 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGHV2-5P01817 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV2-5P01817 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHV2-5P01817 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHV2-5P01817 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHV2-5P01817 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHV2-5P01817 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHV2-5P01817 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGHV2-5P01817 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHV2-5P01817 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGHV2-5P01817 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHV2-5P01817 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHV2-5P01817 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHV2-5P01817 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV2-5P01817 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHV2-5P01817 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHV2-5P01817 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHV2-5P01817 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV2-5P01817 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV2-5P01817 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV2-5P01817 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV2-5P01817 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHV2-5P01817 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV2-5P01817 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV2-5P01817 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV2-5P01817 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV2-5P01817 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV2-5P01817 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV2-5P01817 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms