Protein–RNA interactions for Protein: P01723

Ig lambda-1 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01723 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01723 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01723 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01723 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01723 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01723 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01723 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01723 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
P01723 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01723 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01723 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01723 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01723 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01723 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
P01723 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01723 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01723 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
P01723 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01723 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01723 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01723 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01723 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01723 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01723 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01723 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01723 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01723 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01723 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01723 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01723 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01723 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01723 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01723 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01723 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01723 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01723 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01723 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01723 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01723 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01723 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01723 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
P01723 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P01723 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01723 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01723 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01723 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01723 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01723 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01723 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01723 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01723 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01723 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01723 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P01723 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01723 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01723 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01723 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01723 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01723 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01723 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01723 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01723 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01723 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01723 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01723 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01723 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P01723 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01723 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01723 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01723 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01723 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P01723 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01723 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01723 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01723 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01723 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01723 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01723 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01723 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01723 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01723 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01723 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P01723 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01723 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01723 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01723 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01723 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01723 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01723 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01723 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01723 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01723 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01723 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01723 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01723 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01723 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01723 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01723 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01723 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01723 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms