Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNA2P01563 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNA2P01563 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNA2P01563 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNA2P01563 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNA2P01563 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNA2P01563 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNA2P01563 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNA2P01563 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNA2P01563 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA2P01563 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA2P01563 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNA2P01563 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA2P01563 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA2P01563 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA2P01563 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA2P01563 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFNA2P01563 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNA2P01563 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNA2P01563 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNA2P01563 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNA2P01563 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNA2P01563 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNA2P01563 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNA2P01563 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNA2P01563 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNA2P01563 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA2P01563 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNA2P01563 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA2P01563 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNA2P01563 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNA2P01563 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNA2P01563 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNA2P01563 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNA2P01563 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA2P01563 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA2P01563 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNA2P01563 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA2P01563 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA2P01563 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNA2P01563 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms