Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
F13A1P00488 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
F13A1P00488 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
F13A1P00488 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
F13A1P00488 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
F13A1P00488 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
F13A1P00488 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
F13A1P00488 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
F13A1P00488 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
F13A1P00488 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
F13A1P00488 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
F13A1P00488 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
F13A1P00488 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
F13A1P00488 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
F13A1P00488 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
F13A1P00488 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
F13A1P00488 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
F13A1P00488 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
F13A1P00488 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
F13A1P00488 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
F13A1P00488 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
F13A1P00488 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
F13A1P00488 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
F13A1P00488 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
F13A1P00488 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
F13A1P00488 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
F13A1P00488 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
F13A1P00488 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
F13A1P00488 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
F13A1P00488 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
F13A1P00488 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
F13A1P00488 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
F13A1P00488 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
F13A1P00488 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
F13A1P00488 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
F13A1P00488 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
F13A1P00488 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
F13A1P00488 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
F13A1P00488 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
F13A1P00488 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
F13A1P00488 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
F13A1P00488 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
F13A1P00488 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
F13A1P00488 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
F13A1P00488 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
F13A1P00488 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
F13A1P00488 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
F13A1P00488 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
F13A1P00488 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
F13A1P00488 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
F13A1P00488 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
F13A1P00488 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
F13A1P00488 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
F13A1P00488 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
F13A1P00488 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
F13A1P00488 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
F13A1P00488 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
F13A1P00488 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
F13A1P00488 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
F13A1P00488 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
F13A1P00488 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
F13A1P00488 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
F13A1P00488 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
F13A1P00488 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
F13A1P00488 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
F13A1P00488 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
F13A1P00488 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
F13A1P00488 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
F13A1P00488 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
F13A1P00488 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
F13A1P00488 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
F13A1P00488 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
F13A1P00488 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
F13A1P00488 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
F13A1P00488 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
F13A1P00488 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
F13A1P00488 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
F13A1P00488 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
F13A1P00488 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
F13A1P00488 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
F13A1P00488 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
F13A1P00488 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
F13A1P00488 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
F13A1P00488 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
F13A1P00488 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
F13A1P00488 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
F13A1P00488 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
F13A1P00488 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
F13A1P00488 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
F13A1P00488 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
F13A1P00488 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
F13A1P00488 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
F13A1P00488 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
F13A1P00488 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
F13A1P00488 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
F13A1P00488 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
F13A1P00488 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
F13A1P00488 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
F13A1P00488 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
F13A1P00488 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms