Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOMM40O96008 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM40O96008 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOMM40O96008 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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