Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX6O95503 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX6O95503 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX6O95503 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX6O95503 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBX6O95503 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBX6O95503 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX6O95503 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX6O95503 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX6O95503 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX6O95503 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBX6O95503 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX6O95503 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX6O95503 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX6O95503 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX6O95503 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBX6O95503 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBX6O95503 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX6O95503 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX6O95503 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBX6O95503 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CBX6O95503 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBX6O95503 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBX6O95503 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBX6O95503 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX6O95503 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX6O95503 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX6O95503 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CBX6O95503 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX6O95503 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX6O95503 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX6O95503 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX6O95503 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CBX6O95503 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CBX6O95503 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX6O95503 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX6O95503 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX6O95503 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX6O95503 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CBX6O95503 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX6O95503 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBX6O95503 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX6O95503 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX6O95503 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX6O95503 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX6O95503 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX6O95503 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX6O95503 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX6O95503 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX6O95503 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX6O95503 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX6O95503 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX6O95503 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX6O95503 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX6O95503 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX6O95503 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CBX6O95503 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CBX6O95503 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX6O95503 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX6O95503 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBX6O95503 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBX6O95503 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX6O95503 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX6O95503 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CBX6O95503 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CBX6O95503 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CBX6O95503 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX6O95503 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBX6O95503 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX6O95503 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX6O95503 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CBX6O95503 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CBX6O95503 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX6O95503 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX6O95503 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX6O95503 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX6O95503 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBX6O95503 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX6O95503 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX6O95503 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX6O95503 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX6O95503 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX6O95503 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX6O95503 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBX6O95503 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX6O95503 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBX6O95503 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CBX6O95503 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CBX6O95503 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBX6O95503 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBX6O95503 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX6O95503 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX6O95503 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX6O95503 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX6O95503 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBX6O95503 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CBX6O95503 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBX6O95503 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CBX6O95503 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CBX6O95503 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms