Protein–RNA interactions for Protein: O95259

KCNH1, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH1O95259 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH1O95259 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH1O95259 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH1O95259 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH1O95259 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH1O95259 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH1O95259 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH1O95259 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH1O95259 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH1O95259 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH1O95259 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH1O95259 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH1O95259 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH1O95259 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH1O95259 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNH1O95259 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNH1O95259 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNH1O95259 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNH1O95259 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNH1O95259 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNH1O95259 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH1O95259 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH1O95259 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH1O95259 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH1O95259 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH1O95259 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH1O95259 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH1O95259 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH1O95259 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH1O95259 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH1O95259 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH1O95259 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH1O95259 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH1O95259 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNH1O95259 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH1O95259 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH1O95259 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH1O95259 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH1O95259 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH1O95259 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH1O95259 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNH1O95259 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH1O95259 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH1O95259 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH1O95259 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH1O95259 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH1O95259 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH1O95259 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH1O95259 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH1O95259 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH1O95259 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH1O95259 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH1O95259 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH1O95259 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH1O95259 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNH1O95259 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH1O95259 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH1O95259 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms