Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc6O88978 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc6O88978 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc6O88978 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc6O88978 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc6O88978 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc6O88978 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc6O88978 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc6O88978 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc6O88978 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc6O88978 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc6O88978 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrc6O88978 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc6O88978 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc6O88978 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrrc6O88978 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrrc6O88978 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc6O88978 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc6O88978 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc6O88978 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc6O88978 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc6O88978 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc6O88978 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc6O88978 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc6O88978 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc6O88978 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc6O88978 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc6O88978 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc6O88978 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lrrc6O88978 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc6O88978 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc6O88978 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc6O88978 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrrc6O88978 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc6O88978 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc6O88978 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc6O88978 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc6O88978 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc6O88978 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc6O88978 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc6O88978 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc6O88978 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc6O88978 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lrrc6O88978 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc6O88978 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc6O88978 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrrc6O88978 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc6O88978 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc6O88978 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc6O88978 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc6O88978 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc6O88978 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc6O88978 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc6O88978 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc6O88978 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc6O88978 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc6O88978 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc6O88978 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrrc6O88978 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrrc6O88978 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc6O88978 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lrrc6O88978 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrrc6O88978 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc6O88978 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc6O88978 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc6O88978 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc6O88978 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc6O88978 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc6O88978 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc6O88978 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc6O88978 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc6O88978 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc6O88978 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc6O88978 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc6O88978 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc6O88978 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc6O88978 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc6O88978 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrc6O88978 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms