Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ClppO88696 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ClppO88696 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ClppO88696 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ClppO88696 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClppO88696 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ClppO88696 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ClppO88696 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ClppO88696 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ClppO88696 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ClppO88696 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ClppO88696 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ClppO88696 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ClppO88696 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ClppO88696 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ClppO88696 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ClppO88696 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ClppO88696 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ClppO88696 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ClppO88696 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ClppO88696 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ClppO88696 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ClppO88696 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ClppO88696 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ClppO88696 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ClppO88696 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ClppO88696 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ClppO88696 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ClppO88696 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ClppO88696 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ClppO88696 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ClppO88696 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ClppO88696 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ClppO88696 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ClppO88696 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ClppO88696 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClppO88696 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClppO88696 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ClppO88696 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ClppO88696 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ClppO88696 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ClppO88696 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ClppO88696 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ClppO88696 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ClppO88696 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ClppO88696 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ClppO88696 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ClppO88696 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ClppO88696 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ClppO88696 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ClppO88696 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ClppO88696 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClppO88696 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ClppO88696 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ClppO88696 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClppO88696 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClppO88696 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ClppO88696 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ClppO88696 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ClppO88696 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ClppO88696 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ClppO88696 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ClppO88696 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ClppO88696 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ClppO88696 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ClppO88696 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClppO88696 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClppO88696 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClppO88696 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClppO88696 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClppO88696 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClppO88696 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClppO88696 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClppO88696 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ClppO88696 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ClppO88696 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ClppO88696 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ClppO88696 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClppO88696 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClppO88696 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ClppO88696 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ClppO88696 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ClppO88696 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ClppO88696 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ClppO88696 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ClppO88696 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ClppO88696 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ClppO88696 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ClppO88696 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ClppO88696 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ClppO88696 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ClppO88696 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ClppO88696 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ClppO88696 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClppO88696 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClppO88696 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClppO88696 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ClppO88696 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClppO88696 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClppO88696 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms