Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA10O75578 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA10O75578 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA10O75578 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA10O75578 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA10O75578 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA10O75578 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA10O75578 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA10O75578 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA10O75578 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA10O75578 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA10O75578 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA10O75578 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA10O75578 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA10O75578 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA10O75578 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA10O75578 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA10O75578 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA10O75578 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA10O75578 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA10O75578 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA10O75578 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA10O75578 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA10O75578 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA10O75578 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA10O75578 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA10O75578 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA10O75578 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGA10O75578 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA10O75578 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA10O75578 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA10O75578 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA10O75578 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA10O75578 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA10O75578 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA10O75578 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA10O75578 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA10O75578 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA10O75578 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA10O75578 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA10O75578 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA10O75578 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA10O75578 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA10O75578 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA10O75578 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA10O75578 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA10O75578 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGA10O75578 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA10O75578 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA10O75578 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA10O75578 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA10O75578 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA10O75578 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA10O75578 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA10O75578 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGA10O75578 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA10O75578 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA10O75578 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA10O75578 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA10O75578 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA10O75578 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGA10O75578 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA10O75578 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA10O75578 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA10O75578 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA10O75578 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA10O75578 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGA10O75578 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA10O75578 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA10O75578 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA10O75578 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA10O75578 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA10O75578 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA10O75578 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA10O75578 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA10O75578 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA10O75578 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA10O75578 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA10O75578 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA10O75578 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA10O75578 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA10O75578 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA10O75578 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms