Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRF1O75570 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRF1O75570 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRF1O75570 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRF1O75570 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTRF1O75570 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRF1O75570 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTRF1O75570 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRF1O75570 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRF1O75570 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRF1O75570 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1O75570 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1O75570 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1O75570 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1O75570 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1O75570 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1O75570 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1O75570 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1O75570 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRF1O75570 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1O75570 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1O75570 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRF1O75570 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1O75570 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1O75570 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRF1O75570 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRF1O75570 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRF1O75570 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRF1O75570 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRF1O75570 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1O75570 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1O75570 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1O75570 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1O75570 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1O75570 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1O75570 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms