Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLN5O75503 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLN5O75503 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLN5O75503 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLN5O75503 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLN5O75503 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLN5O75503 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLN5O75503 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLN5O75503 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLN5O75503 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLN5O75503 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLN5O75503 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN5O75503 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN5O75503 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN5O75503 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLN5O75503 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLN5O75503 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLN5O75503 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLN5O75503 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLN5O75503 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN5O75503 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN5O75503 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLN5O75503 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLN5O75503 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN5O75503 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN5O75503 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN5O75503 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLN5O75503 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLN5O75503 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLN5O75503 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLN5O75503 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLN5O75503 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN5O75503 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN5O75503 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN5O75503 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN5O75503 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN5O75503 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN5O75503 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN5O75503 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN5O75503 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN5O75503 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN5O75503 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN5O75503 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN5O75503 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN5O75503 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN5O75503 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN5O75503 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN5O75503 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN5O75503 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN5O75503 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN5O75503 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN5O75503 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN5O75503 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN5O75503 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN5O75503 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN5O75503 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN5O75503 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN5O75503 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN5O75503 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN5O75503 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN5O75503 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN5O75503 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN5O75503 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN5O75503 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN5O75503 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN5O75503 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN5O75503 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN5O75503 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN5O75503 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN5O75503 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN5O75503 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN5O75503 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN5O75503 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN5O75503 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN5O75503 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN5O75503 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN5O75503 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN5O75503 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN5O75503 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN5O75503 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN5O75503 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN5O75503 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN5O75503 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN5O75503 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN5O75503 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN5O75503 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLN5O75503 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLN5O75503 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLN5O75503 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN5O75503 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN5O75503 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN5O75503 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLN5O75503 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN5O75503 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN5O75503 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN5O75503 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN5O75503 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLN5O75503 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLN5O75503 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLN5O75503 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms