Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KATNA1O75449 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KATNA1O75449 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KATNA1O75449 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KATNA1O75449 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KATNA1O75449 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KATNA1O75449 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KATNA1O75449 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KATNA1O75449 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KATNA1O75449 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KATNA1O75449 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KATNA1O75449 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KATNA1O75449 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KATNA1O75449 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KATNA1O75449 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KATNA1O75449 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KATNA1O75449 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KATNA1O75449 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KATNA1O75449 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KATNA1O75449 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KATNA1O75449 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KATNA1O75449 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KATNA1O75449 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KATNA1O75449 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KATNA1O75449 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KATNA1O75449 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KATNA1O75449 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KATNA1O75449 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KATNA1O75449 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KATNA1O75449 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KATNA1O75449 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KATNA1O75449 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KATNA1O75449 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KATNA1O75449 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KATNA1O75449 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KATNA1O75449 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KATNA1O75449 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KATNA1O75449 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KATNA1O75449 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KATNA1O75449 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KATNA1O75449 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KATNA1O75449 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KATNA1O75449 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KATNA1O75449 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KATNA1O75449 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KATNA1O75449 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms