Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3BO75182 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3BO75182 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3BO75182 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3BO75182 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3BO75182 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3BO75182 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3BO75182 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3BO75182 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3BO75182 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3BO75182 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3BO75182 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3BO75182 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3BO75182 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3BO75182 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3BO75182 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3BO75182 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3BO75182 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3BO75182 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3BO75182 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3BO75182 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3BO75182 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3BO75182 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3BO75182 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3BO75182 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3BO75182 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3BO75182 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3BO75182 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3BO75182 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3BO75182 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3BO75182 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3BO75182 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3BO75182 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3BO75182 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3BO75182 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3BO75182 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3BO75182 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3BO75182 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3BO75182 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3BO75182 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3BO75182 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3BO75182 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3BO75182 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3BO75182 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3BO75182 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3BO75182 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3BO75182 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3BO75182 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3BO75182 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3BO75182 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3BO75182 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3BO75182 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3BO75182 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3BO75182 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3BO75182 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3BO75182 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3BO75182 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3BO75182 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3BO75182 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3BO75182 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3BO75182 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3BO75182 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3BO75182 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3BO75182 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3BO75182 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3BO75182 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3BO75182 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3BO75182 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3BO75182 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3BO75182 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIN3BO75182 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3BO75182 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms