Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psma3O70435 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psma3O70435 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psma3O70435 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psma3O70435 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psma3O70435 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psma3O70435 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psma3O70435 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psma3O70435 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psma3O70435 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psma3O70435 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psma3O70435 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psma3O70435 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psma3O70435 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Psma3O70435 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psma3O70435 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psma3O70435 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Psma3O70435 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psma3O70435 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psma3O70435 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psma3O70435 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psma3O70435 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psma3O70435 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psma3O70435 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psma3O70435 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psma3O70435 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psma3O70435 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Psma3O70435 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psma3O70435 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psma3O70435 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psma3O70435 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psma3O70435 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psma3O70435 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psma3O70435 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psma3O70435 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Psma3O70435 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psma3O70435 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psma3O70435 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Psma3O70435 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psma3O70435 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psma3O70435 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psma3O70435 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psma3O70435 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psma3O70435 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psma3O70435 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psma3O70435 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psma3O70435 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psma3O70435 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psma3O70435 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psma3O70435 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psma3O70435 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psma3O70435 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psma3O70435 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psma3O70435 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psma3O70435 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psma3O70435 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psma3O70435 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psma3O70435 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psma3O70435 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Psma3O70435 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Psma3O70435 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psma3O70435 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psma3O70435 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psma3O70435 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Psma3O70435 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psma3O70435 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psma3O70435 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psma3O70435 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Psma3O70435 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psma3O70435 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psma3O70435 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psma3O70435 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psma3O70435 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psma3O70435 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psma3O70435 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psma3O70435 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psma3O70435 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Psma3O70435 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psma3O70435 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Psma3O70435 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psma3O70435 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psma3O70435 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Psma3O70435 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psma3O70435 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psma3O70435 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psma3O70435 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psma3O70435 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psma3O70435 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Psma3O70435 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psma3O70435 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psma3O70435 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms