Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
OPHN1O60890 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
OPHN1O60890 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
OPHN1O60890 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
OPHN1O60890 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
OPHN1O60890 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
OPHN1O60890 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
OPHN1O60890 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
OPHN1O60890 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
OPHN1O60890 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
OPHN1O60890 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
OPHN1O60890 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
OPHN1O60890 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
OPHN1O60890 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OPHN1O60890 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OPHN1O60890 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OPHN1O60890 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OPHN1O60890 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OPHN1O60890 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OPHN1O60890 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
OPHN1O60890 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
OPHN1O60890 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
OPHN1O60890 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
OPHN1O60890 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
OPHN1O60890 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OPHN1O60890 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
OPHN1O60890 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
OPHN1O60890 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
OPHN1O60890 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OPHN1O60890 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OPHN1O60890 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OPHN1O60890 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
OPHN1O60890 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
OPHN1O60890 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
OPHN1O60890 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
OPHN1O60890 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OPHN1O60890 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OPHN1O60890 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OPHN1O60890 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
OPHN1O60890 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OPHN1O60890 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
OPHN1O60890 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
OPHN1O60890 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OPHN1O60890 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OPHN1O60890 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OPHN1O60890 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OPHN1O60890 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
OPHN1O60890 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OPHN1O60890 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OPHN1O60890 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
OPHN1O60890 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OPHN1O60890 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPHN1O60890 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPHN1O60890 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms