Protein–RNA interactions for Protein: O60243

HS6ST1, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST1O60243 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HS6ST1O60243 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HS6ST1O60243 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS6ST1O60243 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS6ST1O60243 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HS6ST1O60243 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HS6ST1O60243 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS6ST1O60243 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HS6ST1O60243 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HS6ST1O60243 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HS6ST1O60243 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HS6ST1O60243 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HS6ST1O60243 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS6ST1O60243 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HS6ST1O60243 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS6ST1O60243 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS6ST1O60243 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS6ST1O60243 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS6ST1O60243 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS6ST1O60243 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HS6ST1O60243 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HS6ST1O60243 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HS6ST1O60243 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HS6ST1O60243 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HS6ST1O60243 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HS6ST1O60243 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HS6ST1O60243 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS6ST1O60243 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS6ST1O60243 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS6ST1O60243 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS6ST1O60243 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS6ST1O60243 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HS6ST1O60243 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS6ST1O60243 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS6ST1O60243 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HS6ST1O60243 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HS6ST1O60243 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HS6ST1O60243 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HS6ST1O60243 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HS6ST1O60243 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HS6ST1O60243 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HS6ST1O60243 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HS6ST1O60243 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HS6ST1O60243 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HS6ST1O60243 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HS6ST1O60243 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS6ST1O60243 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HS6ST1O60243 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS6ST1O60243 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS6ST1O60243 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS6ST1O60243 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS6ST1O60243 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HS6ST1O60243 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HS6ST1O60243 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HS6ST1O60243 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HS6ST1O60243 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms