Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC28A2O43868 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC28A2O43868 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC28A2O43868 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC28A2O43868 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC28A2O43868 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC28A2O43868 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC28A2O43868 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC28A2O43868 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC28A2O43868 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC28A2O43868 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC28A2O43868 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC28A2O43868 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC28A2O43868 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC28A2O43868 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC28A2O43868 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC28A2O43868 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A2O43868 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A2O43868 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A2O43868 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A2O43868 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC28A2O43868 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC28A2O43868 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC28A2O43868 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC28A2O43868 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC28A2O43868 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC28A2O43868 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC28A2O43868 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC28A2O43868 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC28A2O43868 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC28A2O43868 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC28A2O43868 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC28A2O43868 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC28A2O43868 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC28A2O43868 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC28A2O43868 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC28A2O43868 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC28A2O43868 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC28A2O43868 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC28A2O43868 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC28A2O43868 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC28A2O43868 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC28A2O43868 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC28A2O43868 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC28A2O43868 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC28A2O43868 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC28A2O43868 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC28A2O43868 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC28A2O43868 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC28A2O43868 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC28A2O43868 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC28A2O43868 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC28A2O43868 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC28A2O43868 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC28A2O43868 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC28A2O43868 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC28A2O43868 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC28A2O43868 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC28A2O43868 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC28A2O43868 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC28A2O43868 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC28A2O43868 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC28A2O43868 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC28A2O43868 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC28A2O43868 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC28A2O43868 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC28A2O43868 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC28A2O43868 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms