Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STX6O43752 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STX6O43752 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
STX6O43752 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STX6O43752 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STX6O43752 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STX6O43752 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
STX6O43752 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STX6O43752 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
STX6O43752 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STX6O43752 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STX6O43752 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STX6O43752 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STX6O43752 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STX6O43752 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
STX6O43752 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
STX6O43752 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STX6O43752 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
STX6O43752 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STX6O43752 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STX6O43752 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
STX6O43752 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STX6O43752 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
STX6O43752 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
STX6O43752 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
STX6O43752 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
STX6O43752 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
STX6O43752 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STX6O43752 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STX6O43752 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
STX6O43752 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STX6O43752 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STX6O43752 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
STX6O43752 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
STX6O43752 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
STX6O43752 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
STX6O43752 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
STX6O43752 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
STX6O43752 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
STX6O43752 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
STX6O43752 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
STX6O43752 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
STX6O43752 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
STX6O43752 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
STX6O43752 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
STX6O43752 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STX6O43752 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
STX6O43752 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
STX6O43752 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
STX6O43752 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STX6O43752 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
STX6O43752 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
STX6O43752 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
STX6O43752 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
STX6O43752 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
STX6O43752 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STX6O43752 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
STX6O43752 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STX6O43752 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STX6O43752 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STX6O43752 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STX6O43752 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STX6O43752 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
STX6O43752 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
STX6O43752 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STX6O43752 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
STX6O43752 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
STX6O43752 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
STX6O43752 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
STX6O43752 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
STX6O43752 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
STX6O43752 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STX6O43752 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
STX6O43752 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STX6O43752 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
STX6O43752 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
STX6O43752 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
STX6O43752 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
STX6O43752 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STX6O43752 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STX6O43752 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
STX6O43752 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
STX6O43752 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
STX6O43752 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
STX6O43752 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
STX6O43752 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
STX6O43752 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
STX6O43752 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
STX6O43752 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STX6O43752 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
STX6O43752 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STX6O43752 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
STX6O43752 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
STX6O43752 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
STX6O43752 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
STX6O43752 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
STX6O43752 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STX6O43752 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
STX6O43752 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
STX6O43752 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms