Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TIMM44O43615 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TIMM44O43615 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TIMM44O43615 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TIMM44O43615 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TIMM44O43615 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TIMM44O43615 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TIMM44O43615 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TIMM44O43615 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TIMM44O43615 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TIMM44O43615 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TIMM44O43615 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TIMM44O43615 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TIMM44O43615 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TIMM44O43615 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TIMM44O43615 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TIMM44O43615 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TIMM44O43615 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TIMM44O43615 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TIMM44O43615 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TIMM44O43615 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TIMM44O43615 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TIMM44O43615 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TIMM44O43615 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TIMM44O43615 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TIMM44O43615 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TIMM44O43615 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TIMM44O43615 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TIMM44O43615 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TIMM44O43615 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TIMM44O43615 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TIMM44O43615 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TIMM44O43615 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TIMM44O43615 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TIMM44O43615 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TIMM44O43615 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TIMM44O43615 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TIMM44O43615 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TIMM44O43615 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TIMM44O43615 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TIMM44O43615 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TIMM44O43615 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TIMM44O43615 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TIMM44O43615 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TIMM44O43615 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TIMM44O43615 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TIMM44O43615 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TIMM44O43615 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TIMM44O43615 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TIMM44O43615 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TIMM44O43615 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TIMM44O43615 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TIMM44O43615 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TIMM44O43615 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TIMM44O43615 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TIMM44O43615 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TIMM44O43615 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TIMM44O43615 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TIMM44O43615 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TIMM44O43615 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TIMM44O43615 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TIMM44O43615 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TIMM44O43615 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TIMM44O43615 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TIMM44O43615 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TIMM44O43615 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TIMM44O43615 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TIMM44O43615 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TIMM44O43615 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TIMM44O43615 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TIMM44O43615 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TIMM44O43615 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TIMM44O43615 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TIMM44O43615 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TIMM44O43615 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TIMM44O43615 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TIMM44O43615 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TIMM44O43615 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TIMM44O43615 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TIMM44O43615 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms