Protein–RNA interactions for Protein: O43390

HNRNPR, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPRO43390 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HNRNPRO43390 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HNRNPRO43390 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HNRNPRO43390 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HNRNPRO43390 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HNRNPRO43390 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HNRNPRO43390 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HNRNPRO43390 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HNRNPRO43390 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HNRNPRO43390 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HNRNPRO43390 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HNRNPRO43390 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HNRNPRO43390 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HNRNPRO43390 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HNRNPRO43390 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HNRNPRO43390 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HNRNPRO43390 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HNRNPRO43390 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HNRNPRO43390 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HNRNPRO43390 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HNRNPRO43390 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HNRNPRO43390 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HNRNPRO43390 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HNRNPRO43390 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HNRNPRO43390 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HNRNPRO43390 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HNRNPRO43390 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HNRNPRO43390 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HNRNPRO43390 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HNRNPRO43390 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HNRNPRO43390 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HNRNPRO43390 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HNRNPRO43390 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HNRNPRO43390 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HNRNPRO43390 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HNRNPRO43390 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HNRNPRO43390 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HNRNPRO43390 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HNRNPRO43390 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HNRNPRO43390 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HNRNPRO43390 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HNRNPRO43390 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HNRNPRO43390 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HNRNPRO43390 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HNRNPRO43390 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HNRNPRO43390 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HNRNPRO43390 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HNRNPRO43390 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HNRNPRO43390 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HNRNPRO43390 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HNRNPRO43390 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HNRNPRO43390 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HNRNPRO43390 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HNRNPRO43390 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HNRNPRO43390 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HNRNPRO43390 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HNRNPRO43390 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HNRNPRO43390 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HNRNPRO43390 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HNRNPRO43390 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HNRNPRO43390 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HNRNPRO43390 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HNRNPRO43390 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNRNPRO43390 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HNRNPRO43390 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HNRNPRO43390 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HNRNPRO43390 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HNRNPRO43390 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNRNPRO43390 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HNRNPRO43390 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HNRNPRO43390 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNRNPRO43390 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms