Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dsg3O35902 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dsg3O35902 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dsg3O35902 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dsg3O35902 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dsg3O35902 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dsg3O35902 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Dsg3O35902 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dsg3O35902 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dsg3O35902 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dsg3O35902 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Dsg3O35902 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dsg3O35902 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Dsg3O35902 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Dsg3O35902 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Dsg3O35902 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Dsg3O35902 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Dsg3O35902 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Dsg3O35902 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Dsg3O35902 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dsg3O35902 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dsg3O35902 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dsg3O35902 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dsg3O35902 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Dsg3O35902 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dsg3O35902 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dsg3O35902 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Dsg3O35902 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dsg3O35902 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Dsg3O35902 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dsg3O35902 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dsg3O35902 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dsg3O35902 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dsg3O35902 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dsg3O35902 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dsg3O35902 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dsg3O35902 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dsg3O35902 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dsg3O35902 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dsg3O35902 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dsg3O35902 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dsg3O35902 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dsg3O35902 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dsg3O35902 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dsg3O35902 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dsg3O35902 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dsg3O35902 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dsg3O35902 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dsg3O35902 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Dsg3O35902 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Dsg3O35902 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dsg3O35902 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Dsg3O35902 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dsg3O35902 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dsg3O35902 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dsg3O35902 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dsg3O35902 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dsg3O35902 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dsg3O35902 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Dsg3O35902 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dsg3O35902 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dsg3O35902 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dsg3O35902 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dsg3O35902 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dsg3O35902 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dsg3O35902 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dsg3O35902 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dsg3O35902 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dsg3O35902 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dsg3O35902 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dsg3O35902 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dsg3O35902 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dsg3O35902 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dsg3O35902 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dsg3O35902 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Dsg3O35902 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dsg3O35902 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dsg3O35902 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dsg3O35902 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dsg3O35902 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dsg3O35902 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dsg3O35902 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dsg3O35902 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dsg3O35902 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dsg3O35902 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dsg3O35902 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dsg3O35902 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dsg3O35902 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dsg3O35902 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dsg3O35902 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dsg3O35902 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dsg3O35902 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dsg3O35902 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dsg3O35902 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dsg3O35902 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dsg3O35902 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dsg3O35902 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms