Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf12O35738 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf12O35738 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf12O35738 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf12O35738 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf12O35738 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf12O35738 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf12O35738 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf12O35738 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf12O35738 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf12O35738 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf12O35738 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf12O35738 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf12O35738 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf12O35738 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf12O35738 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf12O35738 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klf12O35738 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf12O35738 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf12O35738 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf12O35738 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf12O35738 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf12O35738 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf12O35738 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf12O35738 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf12O35738 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf12O35738 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf12O35738 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf12O35738 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klf12O35738 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klf12O35738 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf12O35738 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf12O35738 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf12O35738 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf12O35738 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf12O35738 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf12O35738 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf12O35738 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf12O35738 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf12O35738 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf12O35738 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf12O35738 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf12O35738 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf12O35738 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf12O35738 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf12O35738 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf12O35738 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf12O35738 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf12O35738 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf12O35738 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf12O35738 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf12O35738 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf12O35738 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf12O35738 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf12O35738 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf12O35738 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf12O35738 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf12O35738 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf12O35738 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf12O35738 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf12O35738 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf12O35738 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf12O35738 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf12O35738 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf12O35738 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf12O35738 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf12O35738 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf12O35738 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf12O35738 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf12O35738 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf12O35738 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf12O35738 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf12O35738 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf12O35738 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms