Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ifnar2O35664 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ifnar2O35664 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ifnar2O35664 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ifnar2O35664 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ifnar2O35664 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ifnar2O35664 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ifnar2O35664 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ifnar2O35664 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ifnar2O35664 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ifnar2O35664 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ifnar2O35664 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ifnar2O35664 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ifnar2O35664 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ifnar2O35664 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ifnar2O35664 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ifnar2O35664 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ifnar2O35664 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ifnar2O35664 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ifnar2O35664 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ifnar2O35664 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ifnar2O35664 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ifnar2O35664 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ifnar2O35664 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ifnar2O35664 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ifnar2O35664 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ifnar2O35664 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ifnar2O35664 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ifnar2O35664 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ifnar2O35664 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ifnar2O35664 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ifnar2O35664 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ifnar2O35664 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ifnar2O35664 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ifnar2O35664 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ifnar2O35664 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ifnar2O35664 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ifnar2O35664 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ifnar2O35664 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ifnar2O35664 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ifnar2O35664 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ifnar2O35664 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ifnar2O35664 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ifnar2O35664 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ifnar2O35664 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ifnar2O35664 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ifnar2O35664 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ifnar2O35664 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ifnar2O35664 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ifnar2O35664 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ifnar2O35664 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ifnar2O35664 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifnar2O35664 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifnar2O35664 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ifnar2O35664 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ifnar2O35664 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ifnar2O35664 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ifnar2O35664 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ifnar2O35664 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ifnar2O35664 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ifnar2O35664 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ifnar2O35664 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ifnar2O35664 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ifnar2O35664 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ifnar2O35664 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ifnar2O35664 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ifnar2O35664 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ifnar2O35664 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ifnar2O35664 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ifnar2O35664 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ifnar2O35664 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ifnar2O35664 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ifnar2O35664 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ifnar2O35664 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ifnar2O35664 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ifnar2O35664 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ifnar2O35664 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ifnar2O35664 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifnar2O35664 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ifnar2O35664 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifnar2O35664 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ifnar2O35664 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ifnar2O35664 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ifnar2O35664 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifnar2O35664 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifnar2O35664 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifnar2O35664 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifnar2O35664 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ifnar2O35664 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ifnar2O35664 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ifnar2O35664 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifnar2O35664 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms