Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih1O35372 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih1O35372 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih1O35372 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnih1O35372 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnih1O35372 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnih1O35372 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnih1O35372 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnih1O35372 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih1O35372 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih1O35372 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih1O35372 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih1O35372 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih1O35372 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnih1O35372 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnih1O35372 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih1O35372 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnih1O35372 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnih1O35372 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnih1O35372 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnih1O35372 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnih1O35372 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnih1O35372 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnih1O35372 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih1O35372 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnih1O35372 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnih1O35372 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih1O35372 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih1O35372 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih1O35372 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnih1O35372 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnih1O35372 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnih1O35372 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnih1O35372 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnih1O35372 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih1O35372 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih1O35372 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih1O35372 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih1O35372 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnih1O35372 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnih1O35372 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnih1O35372 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnih1O35372 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih1O35372 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih1O35372 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih1O35372 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih1O35372 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih1O35372 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih1O35372 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih1O35372 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih1O35372 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnih1O35372 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnih1O35372 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih1O35372 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih1O35372 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih1O35372 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih1O35372 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih1O35372 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih1O35372 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnih1O35372 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnih1O35372 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih1O35372 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih1O35372 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih1O35372 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih1O35372 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih1O35372 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih1O35372 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih1O35372 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnih1O35372 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnih1O35372 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnih1O35372 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih1O35372 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih1O35372 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih1O35372 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih1O35372 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnih1O35372 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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