Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHADO15335 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CHADO15335 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHADO15335 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHADO15335 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHADO15335 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHADO15335 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHADO15335 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHADO15335 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHADO15335 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHADO15335 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHADO15335 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHADO15335 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHADO15335 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHADO15335 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHADO15335 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHADO15335 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CHADO15335 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHADO15335 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHADO15335 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHADO15335 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHADO15335 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHADO15335 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHADO15335 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHADO15335 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHADO15335 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHADO15335 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHADO15335 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHADO15335 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHADO15335 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHADO15335 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHADO15335 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHADO15335 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHADO15335 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHADO15335 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHADO15335 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHADO15335 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHADO15335 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHADO15335 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHADO15335 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHADO15335 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHADO15335 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHADO15335 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHADO15335 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHADO15335 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHADO15335 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHADO15335 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHADO15335 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHADO15335 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHADO15335 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHADO15335 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHADO15335 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHADO15335 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHADO15335 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHADO15335 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHADO15335 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHADO15335 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHADO15335 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHADO15335 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHADO15335 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHADO15335 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHADO15335 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHADO15335 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHADO15335 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHADO15335 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHADO15335 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHADO15335 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHADO15335 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHADO15335 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CHADO15335 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHADO15335 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHADO15335 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHADO15335 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHADO15335 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CHADO15335 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHADO15335 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHADO15335 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHADO15335 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHADO15335 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHADO15335 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CHADO15335 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHADO15335 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHADO15335 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHADO15335 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHADO15335 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHADO15335 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHADO15335 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHADO15335 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHADO15335 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHADO15335 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHADO15335 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHADO15335 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHADO15335 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHADO15335 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHADO15335 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHADO15335 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHADO15335 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHADO15335 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHADO15335 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHADO15335 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms