Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GIPC1O14908 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GIPC1O14908 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GIPC1O14908 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GIPC1O14908 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GIPC1O14908 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GIPC1O14908 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GIPC1O14908 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GIPC1O14908 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GIPC1O14908 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GIPC1O14908 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GIPC1O14908 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GIPC1O14908 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GIPC1O14908 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GIPC1O14908 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GIPC1O14908 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GIPC1O14908 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GIPC1O14908 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GIPC1O14908 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GIPC1O14908 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GIPC1O14908 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GIPC1O14908 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GIPC1O14908 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GIPC1O14908 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GIPC1O14908 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GIPC1O14908 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GIPC1O14908 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GIPC1O14908 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GIPC1O14908 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GIPC1O14908 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GIPC1O14908 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GIPC1O14908 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GIPC1O14908 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GIPC1O14908 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GIPC1O14908 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GIPC1O14908 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GIPC1O14908 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GIPC1O14908 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GIPC1O14908 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GIPC1O14908 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GIPC1O14908 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GIPC1O14908 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GIPC1O14908 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GIPC1O14908 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GIPC1O14908 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GIPC1O14908 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GIPC1O14908 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GIPC1O14908 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GIPC1O14908 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GIPC1O14908 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GIPC1O14908 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GIPC1O14908 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GIPC1O14908 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GIPC1O14908 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GIPC1O14908 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GIPC1O14908 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GIPC1O14908 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GIPC1O14908 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GIPC1O14908 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GIPC1O14908 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GIPC1O14908 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GIPC1O14908 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GIPC1O14908 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GIPC1O14908 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GIPC1O14908 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GIPC1O14908 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GIPC1O14908 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GIPC1O14908 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GIPC1O14908 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GIPC1O14908 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GIPC1O14908 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GIPC1O14908 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GIPC1O14908 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIPC1O14908 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIPC1O14908 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GIPC1O14908 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GIPC1O14908 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms