Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMP1O14524 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMP1O14524 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMP1O14524 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMP1O14524 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMP1O14524 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEMP1O14524 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEMP1O14524 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEMP1O14524 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEMP1O14524 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEMP1O14524 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEMP1O14524 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEMP1O14524 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEMP1O14524 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEMP1O14524 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEMP1O14524 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEMP1O14524 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEMP1O14524 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEMP1O14524 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEMP1O14524 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEMP1O14524 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEMP1O14524 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEMP1O14524 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEMP1O14524 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEMP1O14524 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEMP1O14524 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEMP1O14524 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEMP1O14524 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEMP1O14524 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEMP1O14524 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEMP1O14524 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEMP1O14524 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEMP1O14524 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEMP1O14524 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEMP1O14524 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEMP1O14524 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEMP1O14524 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMP1O14524 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMP1O14524 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEMP1O14524 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEMP1O14524 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEMP1O14524 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEMP1O14524 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEMP1O14524 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEMP1O14524 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEMP1O14524 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEMP1O14524 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEMP1O14524 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEMP1O14524 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMP1O14524 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEMP1O14524 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEMP1O14524 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEMP1O14524 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEMP1O14524 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEMP1O14524 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEMP1O14524 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEMP1O14524 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEMP1O14524 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NEMP1O14524 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEMP1O14524 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEMP1O14524 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEMP1O14524 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEMP1O14524 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEMP1O14524 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEMP1O14524 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEMP1O14524 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEMP1O14524 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEMP1O14524 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEMP1O14524 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEMP1O14524 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEMP1O14524 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEMP1O14524 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEMP1O14524 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEMP1O14524 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEMP1O14524 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEMP1O14524 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEMP1O14524 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEMP1O14524 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEMP1O14524 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEMP1O14524 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEMP1O14524 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEMP1O14524 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEMP1O14524 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEMP1O14524 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEMP1O14524 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMP1O14524 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMP1O14524 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMP1O14524 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMP1O14524 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEMP1O14524 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEMP1O14524 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEMP1O14524 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms