Protein–RNA interactions for Protein: O13559

YRF1-4, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 4, yeastyeast

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Length 1,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-4O13559 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.85■□□□□ 0.13
YRF1-4O13559 ALF1YNL148C 765 nt15.84■□□□□ 0.13
YRF1-4O13559 YPS1YLR120C 1710 nt15.83■□□□□ 0.12
YRF1-4O13559 YDR095CYDR095C 411 nt15.78■□□□□ 0.12
YRF1-4O13559 UBX6YJL048C 1191 nt15.73■□□□□ 0.11
YRF1-4O13559 ADO1YJR105W 1023 nt15.72■□□□□ 0.11
YRF1-4O13559 LPX1YOR084W 1164 nt15.72■□□□□ 0.11
YRF1-4O13559 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.71■□□□□ 0.11
YRF1-4O13559 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.7■□□□□ 0.1
YRF1-4O13559 YEL076CYEL076C 651 nt15.7■□□□□ 0.1
YRF1-4O13559 YLR464WYLR464W 651 nt15.7■□□□□ 0.1
YRF1-4O13559 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.69■□□□□ 0.1
YRF1-4O13559 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.69■□□□□ 0.1
YRF1-4O13559 SPP1YPL138C 1062 nt15.68■□□□□ 0.1
YRF1-4O13559 YJL152WYJL152W 360 nt15.66■□□□□ 0.1
YRF1-4O13559 ERV46YAL042W 1248 nt15.63■□□□□ 0.09
YRF1-4O13559 RTG1YOL067C 534 nt15.63■□□□□ 0.09
YRF1-4O13559 SPT5YML010W 3192 nt15.6■□□□□ 0.09
YRF1-4O13559 MEP2YNL142W 1500 nt15.58■□□□□ 0.08
YRF1-4O13559 TIR4YOR009W 1464 nt15.57■□□□□ 0.08
YRF1-4O13559 SIS1YNL007C 1059 nt15.53■□□□□ 0.08
YRF1-4O13559 IDH1YNL037C 1083 nt15.48■□□□□ 0.07
YRF1-4O13559 RPP2AYOL039W 321 nt15.45■□□□□ 0.06
YRF1-4O13559 PTP1YDL230W 1008 nt15.43■□□□□ 0.06
YRF1-4O13559 DCW1YKL046C 1350 nt15.43■□□□□ 0.06
YRF1-4O13559 ART5YGR068C 1761 nt15.42■□□□□ 0.06
YRF1-4O13559 YDR433WYDR433W 441 nt15.41■□□□□ 0.06
YRF1-4O13559 YKR040CYKR040C 504 nt15.36■□□□□ 0.05
YRF1-4O13559 SSA4YER103W 1929 nt15.35■□□□□ 0.05
YRF1-4O13559 GFD2YCL036W 1701 nt15.33■□□□□ 0.04
YRF1-4O13559 YMR057CYMR057C 372 nt15.32■□□□□ 0.04
YRF1-4O13559 MXR2YCL033C 507 nt15.31■□□□□ 0.04
YRF1-4O13559 CAC2YML102W 1407 nt15.31■□□□□ 0.04
YRF1-4O13559 YDR094WYDR094W 336 nt15.28■□□□□ 0.04
YRF1-4O13559 RTS2YOR077W 699 nt15.28■□□□□ 0.04
YRF1-4O13559 GBP2YCL011C 1284 nt15.27■□□□□ 0.04
YRF1-4O13559 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.24■□□□□ 0.03
YRF1-4O13559 HUA1YGR268C 597 nt15.23■□□□□ 0.03
YRF1-4O13559 PET9YBL030C 957 nt15.2■□□□□ 0.02
YRF1-4O13559 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.2■□□□□ 0.02
YRF1-4O13559 EMI2YDR516C 1503 nt15.2■□□□□ 0.02
YRF1-4O13559 YMR090WYMR090W 684 nt15.08■□□□□ 0
YRF1-4O13559 IRC15YPL017C 1500 nt15.06■□□□□ 0
YRF1-4O13559 YDL221WYDL221W 552 nt15.05■□□□□ -0
YRF1-4O13559 FPS1YLL043W 2010 nt15.04■□□□□ -0
YRF1-4O13559 TCD2YKL027W 1344 nt15.02□□□□□ -0.01
YRF1-4O13559 DED1YOR204W 1815 nt14.97□□□□□ -0.01
YRF1-4O13559 FRD1YEL047C 1413 nt14.97□□□□□ -0.01
YRF1-4O13559 RRD1YIL153W 1182 nt14.96□□□□□ -0.02
YRF1-4O13559 GIS3YLR094C 1509 nt14.91□□□□□ -0.02
YRF1-4O13559 PTH1YHR189W 573 nt14.9□□□□□ -0.02
YRF1-4O13559 CUE1YMR264W 612 nt14.9□□□□□ -0.02
YRF1-4O13559 SDH1YKL148C 1923 nt14.86□□□□□ -0.03
YRF1-4O13559 YBR220CYBR220C 1683 nt14.84□□□□□ -0.03
YRF1-4O13559 SBA1YKL117W 651 nt14.84□□□□□ -0.03
YRF1-4O13559 FMT1YBL013W 1206 nt14.84□□□□□ -0.03
YRF1-4O13559 YKL030WYKL030W 606 nt14.81□□□□□ -0.04
YRF1-4O13559 SCC4YER147C 1875 nt14.79□□□□□ -0.04
YRF1-4O13559 YLR235CYLR235C 399 nt14.76□□□□□ -0.05
YRF1-4O13559 SOR2YDL246C 1074 nt14.74□□□□□ -0.05
YRF1-4O13559 SOR1YJR159W 1074 nt14.74□□□□□ -0.05
YRF1-4O13559 PAU16YKL224C 372 nt14.74□□□□□ -0.05
YRF1-4O13559 YCL042WYCL042W 360 nt14.74□□□□□ -0.05
YRF1-4O13559 LCB1YMR296C 1677 nt14.72□□□□□ -0.05
YRF1-4O13559 YIL100WYIL100W 354 nt14.72□□□□□ -0.05
YRF1-4O13559 CWP1YKL096W 720 nt14.66□□□□□ -0.06
YRF1-4O13559 ADH2YMR303C 1047 nt14.62□□□□□ -0.07
YRF1-4O13559 YFR018CYFR018C 1092 nt14.61□□□□□ -0.07
YRF1-4O13559 BDF1YLR399C 2061 nt14.59□□□□□ -0.07
YRF1-4O13559 PRE6YOL038W 765 nt14.59□□□□□ -0.07
YRF1-4O13559 FMP52YER004W 696 nt14.54□□□□□ -0.08
YRF1-4O13559 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.52□□□□□ -0.08
YRF1-4O13559 YSC84YHR016C 1407 nt14.51□□□□□ -0.09
YRF1-4O13559 RRT5YFR032C 870 nt14.5□□□□□ -0.09
YRF1-4O13559 YNL195CYNL195C 786 nt14.5□□□□□ -0.09
YRF1-4O13559 TAT1YBR069C 1860 nt14.46□□□□□ -0.09
YRF1-4O13559 RRT12YCR045C 1476 nt14.45□□□□□ -0.1
YRF1-4O13559 PCM1YEL058W 1674 nt14.45□□□□□ -0.1
YRF1-4O13559 TIM23YNR017W 669 nt14.45□□□□□ -0.1
YRF1-4O13559 DIC1YLR348C 897 nt14.43□□□□□ -0.1
YRF1-4O13559 SNF6YHL025W 999 nt14.42□□□□□ -0.1
YRF1-4O13559 YLR179CYLR179C 606 nt14.32□□□□□ -0.12
YRF1-4O13559 SEC11YIR022W 504 nt14.31□□□□□ -0.12
YRF1-4O13559 YHL050CYHL050C 2094 nt14.3□□□□□ -0.12
YRF1-4O13559 YPR064WYPR064W 420 nt14.27□□□□□ -0.12
YRF1-4O13559 PCH2YBR186W 1695 nt14.26□□□□□ -0.13
YRF1-4O13559 YIH1YCR059C 777 nt14.24□□□□□ -0.13
YRF1-4O13559 WSC2YNL283C 1512 nt14.23□□□□□ -0.13
YRF1-4O13559 TAD3YLR316C 969 nt14.22□□□□□ -0.13
YRF1-4O13559 BIO4YNR057C 714 nt14.22□□□□□ -0.13
YRF1-4O13559 RNQ1YCL028W 1218 nt14.22□□□□□ -0.13
YRF1-4O13559 YFL066CYFL066C 1179 nt14.2□□□□□ -0.14
YRF1-4O13559 PEX25YPL112C 1185 nt14.18□□□□□ -0.14
YRF1-4O13559 YLL053CYLL053C 459 nt14.17□□□□□ -0.14
YRF1-4O13559 SIM1YIL123W 1431 nt14.16□□□□□ -0.14
YRF1-4O13559 AHT1YHR093W 549 nt14.16□□□□□ -0.14
YRF1-4O13559 NAT4YMR069W 858 nt14.14□□□□□ -0.15
YRF1-4O13559 GUT2YIL155C 1950 nt14.13□□□□□ -0.15
YRF1-4O13559 FTR1YER145C 1215 nt14.06□□□□□ -0.16
YRF1-4O13559 TRM5YHR070W 1500 nt14.03□□□□□ -0.16
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