Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Neurod4O09105 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod4O09105 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Neurod4O09105 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Neurod4O09105 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod4O09105 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod4O09105 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod4O09105 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod4O09105 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod4O09105 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod4O09105 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod4O09105 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod4O09105 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Neurod4O09105 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod4O09105 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod4O09105 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod4O09105 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod4O09105 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod4O09105 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Neurod4O09105 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Neurod4O09105 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod4O09105 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod4O09105 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod4O09105 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod4O09105 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod4O09105 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod4O09105 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod4O09105 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod4O09105 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod4O09105 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod4O09105 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod4O09105 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod4O09105 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod4O09105 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod4O09105 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod4O09105 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod4O09105 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod4O09105 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod4O09105 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod4O09105 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Neurod4O09105 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod4O09105 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Neurod4O09105 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod4O09105 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod4O09105 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod4O09105 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod4O09105 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Neurod4O09105 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Neurod4O09105 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Neurod4O09105 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Neurod4O09105 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Neurod4O09105 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Neurod4O09105 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Neurod4O09105 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Neurod4O09105 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Neurod4O09105 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Neurod4O09105 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Neurod4O09105 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Neurod4O09105 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Neurod4O09105 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod4O09105 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod4O09105 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod4O09105 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod4O09105 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod4O09105 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod4O09105 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod4O09105 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod4O09105 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod4O09105 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod4O09105 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod4O09105 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod4O09105 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod4O09105 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod4O09105 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neurod4O09105 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neurod4O09105 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neurod4O09105 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Neurod4O09105 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neurod4O09105 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neurod4O09105 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neurod4O09105 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neurod4O09105 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neurod4O09105 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Neurod4O09105 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Neurod4O09105 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Neurod4O09105 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Neurod4O09105 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Neurod4O09105 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Neurod4O09105 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Neurod4O09105 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Neurod4O09105 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms