Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cacna2d1O08532 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacna2d1O08532 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cacna2d1O08532 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna2d1O08532 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacna2d1O08532 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna2d1O08532 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna2d1O08532 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna2d1O08532 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cacna2d1O08532 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cacna2d1O08532 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cacna2d1O08532 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacna2d1O08532 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna2d1O08532 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna2d1O08532 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cacna2d1O08532 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacna2d1O08532 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cacna2d1O08532 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cacna2d1O08532 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cacna2d1O08532 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cacna2d1O08532 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacna2d1O08532 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cacna2d1O08532 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna2d1O08532 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cacna2d1O08532 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacna2d1O08532 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cacna2d1O08532 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna2d1O08532 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cacna2d1O08532 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna2d1O08532 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna2d1O08532 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cacna2d1O08532 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cacna2d1O08532 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna2d1O08532 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cacna2d1O08532 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna2d1O08532 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna2d1O08532 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna2d1O08532 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacna2d1O08532 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacna2d1O08532 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cacna2d1O08532 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cacna2d1O08532 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cacna2d1O08532 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cacna2d1O08532 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna2d1O08532 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna2d1O08532 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna2d1O08532 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacna2d1O08532 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacna2d1O08532 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna2d1O08532 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna2d1O08532 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna2d1O08532 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna2d1O08532 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna2d1O08532 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cacna2d1O08532 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna2d1O08532 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacna2d1O08532 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacna2d1O08532 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna2d1O08532 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna2d1O08532 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cacna2d1O08532 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cacna2d1O08532 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacna2d1O08532 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna2d1O08532 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna2d1O08532 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacna2d1O08532 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacna2d1O08532 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna2d1O08532 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna2d1O08532 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna2d1O08532 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna2d1O08532 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna2d1O08532 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna2d1O08532 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna2d1O08532 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacna2d1O08532 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacna2d1O08532 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna2d1O08532 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna2d1O08532 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna2d1O08532 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna2d1O08532 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna2d1O08532 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna2d1O08532 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna2d1O08532 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna2d1O08532 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna2d1O08532 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna2d1O08532 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna2d1O08532 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna2d1O08532 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna2d1O08532 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna2d1O08532 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna2d1O08532 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms