Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.283e-60■■■■■ 100
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DDX3XO00571 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.066e-10■■■■■ 99
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DDX3XO00571 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.484e-12■■■■■ 94.9
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DDX3XO00571 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.084e-18■■■■■ 94.5
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DDX3XO00571 HEXB-213ENST00000515528 876 ntTSL 221.63■■□□□ 1.051e-20■■■■■ 87.8
DDX3XO00571 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.791e-20■■■■■ 87.8
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DDX3XO00571 NELFE-214ENST00000625905 111 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.883e-34■■■■■ 86.2
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DDX3XO00571 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-11■■■■■ 85.6
DDX3XO00571 TMEM121-203ENST00000552019 366 ntTSL 519.02■□□□□ 0.648e-27■■■■■ 85.4
DDX3XO00571 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.142e-12■■■■■ 85.3
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DDX3XO00571 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.296e-27■■■■■ 85.2
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DDX3XO00571 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.022e-17■■■■■ 84.9
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