Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GFRA2O00451 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GFRA2O00451 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GFRA2O00451 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GFRA2O00451 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GFRA2O00451 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GFRA2O00451 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GFRA2O00451 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GFRA2O00451 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GFRA2O00451 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GFRA2O00451 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GFRA2O00451 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GFRA2O00451 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GFRA2O00451 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GFRA2O00451 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GFRA2O00451 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GFRA2O00451 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GFRA2O00451 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GFRA2O00451 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GFRA2O00451 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GFRA2O00451 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GFRA2O00451 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GFRA2O00451 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GFRA2O00451 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GFRA2O00451 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GFRA2O00451 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GFRA2O00451 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GFRA2O00451 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GFRA2O00451 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GFRA2O00451 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GFRA2O00451 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GFRA2O00451 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GFRA2O00451 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GFRA2O00451 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GFRA2O00451 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GFRA2O00451 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GFRA2O00451 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GFRA2O00451 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GFRA2O00451 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GFRA2O00451 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GFRA2O00451 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GFRA2O00451 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GFRA2O00451 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GFRA2O00451 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GFRA2O00451 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GFRA2O00451 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GFRA2O00451 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GFRA2O00451 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GFRA2O00451 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GFRA2O00451 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GFRA2O00451 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GFRA2O00451 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GFRA2O00451 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GFRA2O00451 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GFRA2O00451 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GFRA2O00451 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GFRA2O00451 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GFRA2O00451 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GFRA2O00451 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GFRA2O00451 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GFRA2O00451 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GFRA2O00451 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GFRA2O00451 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GFRA2O00451 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GFRA2O00451 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GFRA2O00451 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GFRA2O00451 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GFRA2O00451 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GFRA2O00451 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GFRA2O00451 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GFRA2O00451 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GFRA2O00451 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GFRA2O00451 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GFRA2O00451 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GFRA2O00451 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GFRA2O00451 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GFRA2O00451 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GFRA2O00451 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GFRA2O00451 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GFRA2O00451 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GFRA2O00451 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GFRA2O00451 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GFRA2O00451 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GFRA2O00451 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GFRA2O00451 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GFRA2O00451 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GFRA2O00451 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GFRA2O00451 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GFRA2O00451 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GFRA2O00451 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GFRA2O00451 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.2 ms