Protein–RNA interactions for Protein: J3KMT3

Gm6882, Predicted gene 6882, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6882J3KMT3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6882J3KMT3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm6882J3KMT3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm6882J3KMT3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm6882J3KMT3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm6882J3KMT3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm6882J3KMT3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm6882J3KMT3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm6882J3KMT3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm6882J3KMT3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm6882J3KMT3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm6882J3KMT3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm6882J3KMT3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm6882J3KMT3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm6882J3KMT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm6882J3KMT3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6882J3KMT3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6882J3KMT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6882J3KMT3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6882J3KMT3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6882J3KMT3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6882J3KMT3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6882J3KMT3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6882J3KMT3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6882J3KMT3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6882J3KMT3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6882J3KMT3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6882J3KMT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6882J3KMT3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm6882J3KMT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6882J3KMT3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6882J3KMT3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6882J3KMT3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6882J3KMT3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6882J3KMT3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6882J3KMT3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6882J3KMT3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6882J3KMT3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6882J3KMT3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6882J3KMT3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6882J3KMT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6882J3KMT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6882J3KMT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6882J3KMT3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6882J3KMT3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6882J3KMT3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6882J3KMT3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6882J3KMT3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6882J3KMT3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6882J3KMT3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6882J3KMT3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6882J3KMT3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6882J3KMT3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6882J3KMT3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6882J3KMT3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6882J3KMT3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6882J3KMT3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6882J3KMT3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6882J3KMT3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6882J3KMT3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6882J3KMT3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6882J3KMT3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6882J3KMT3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6882J3KMT3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6882J3KMT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6882J3KMT3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6882J3KMT3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6882J3KMT3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.5 ms