Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20538F6Z9R1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20538F6Z9R1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20538F6Z9R1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20538F6Z9R1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20538F6Z9R1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20538F6Z9R1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20538F6Z9R1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20538F6Z9R1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20538F6Z9R1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20538F6Z9R1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20538F6Z9R1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20538F6Z9R1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20538F6Z9R1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20538F6Z9R1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20538F6Z9R1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20538F6Z9R1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20538F6Z9R1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20538F6Z9R1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20538F6Z9R1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20538F6Z9R1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20538F6Z9R1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20538F6Z9R1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20538F6Z9R1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20538F6Z9R1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20538F6Z9R1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20538F6Z9R1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms