Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-M11F6U8V3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-M11F6U8V3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-M11F6U8V3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-M11F6U8V3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-M11F6U8V3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-M11F6U8V3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M11F6U8V3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-M11F6U8V3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-M11F6U8V3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-M11F6U8V3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-M11F6U8V3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-M11F6U8V3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-M11F6U8V3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-M11F6U8V3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2-M11F6U8V3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-M11F6U8V3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M11F6U8V3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-M11F6U8V3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-M11F6U8V3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-M11F6U8V3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-M11F6U8V3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-M11F6U8V3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-M11F6U8V3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-M11F6U8V3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-M11F6U8V3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-M11F6U8V3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-M11F6U8V3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-M11F6U8V3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M11F6U8V3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-M11F6U8V3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-M11F6U8V3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-M11F6U8V3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-M11F6U8V3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-M11F6U8V3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-M11F6U8V3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-M11F6U8V3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-M11F6U8V3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-M11F6U8V3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-M11F6U8V3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-M11F6U8V3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-M11F6U8V3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-M11F6U8V3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-M11F6U8V3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-M11F6U8V3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-M11F6U8V3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M11F6U8V3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-M11F6U8V3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-M11F6U8V3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M11F6U8V3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M11F6U8V3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-M11F6U8V3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-M11F6U8V3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-M11F6U8V3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M11F6U8V3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-M11F6U8V3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M11F6U8V3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M11F6U8V3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M11F6U8V3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-M11F6U8V3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M11F6U8V3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M11F6U8V3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M11F6U8V3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
H2-M11F6U8V3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M11F6U8V3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M11F6U8V3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M11F6U8V3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M11F6U8V3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-M11F6U8V3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-M11F6U8V3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-M11F6U8V3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms