Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms