Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBD1B2RD01 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBD1B2RD01 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBD1B2RD01 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBD1B2RD01 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBD1B2RD01 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPBD1B2RD01 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPBD1B2RD01 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBD1B2RD01 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBD1B2RD01 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBD1B2RD01 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBD1B2RD01 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBD1B2RD01 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBD1B2RD01 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBD1B2RD01 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBD1B2RD01 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBD1B2RD01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBD1B2RD01 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBD1B2RD01 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBD1B2RD01 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBD1B2RD01 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBD1B2RD01 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBD1B2RD01 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBD1B2RD01 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBD1B2RD01 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBD1B2RD01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBD1B2RD01 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBD1B2RD01 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBD1B2RD01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBD1B2RD01 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBD1B2RD01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBD1B2RD01 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBD1B2RD01 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBD1B2RD01 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBD1B2RD01 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBD1B2RD01 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBD1B2RD01 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBD1B2RD01 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBD1B2RD01 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBD1B2RD01 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBD1B2RD01 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBD1B2RD01 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBD1B2RD01 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBD1B2RD01 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBD1B2RD01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBD1B2RD01 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBD1B2RD01 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBD1B2RD01 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBD1B2RD01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBD1B2RD01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBD1B2RD01 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBD1B2RD01 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBD1B2RD01 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBD1B2RD01 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBD1B2RD01 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPBD1B2RD01 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBD1B2RD01 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBD1B2RD01 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBD1B2RD01 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBD1B2RD01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBD1B2RD01 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBD1B2RD01 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBD1B2RD01 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms