Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scml2B1AVB3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scml2B1AVB3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scml2B1AVB3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scml2B1AVB3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scml2B1AVB3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scml2B1AVB3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scml2B1AVB3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scml2B1AVB3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scml2B1AVB3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scml2B1AVB3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scml2B1AVB3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scml2B1AVB3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scml2B1AVB3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scml2B1AVB3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scml2B1AVB3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scml2B1AVB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scml2B1AVB3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scml2B1AVB3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scml2B1AVB3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scml2B1AVB3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scml2B1AVB3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scml2B1AVB3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scml2B1AVB3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scml2B1AVB3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scml2B1AVB3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scml2B1AVB3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scml2B1AVB3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scml2B1AVB3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scml2B1AVB3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scml2B1AVB3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scml2B1AVB3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Scml2B1AVB3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scml2B1AVB3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scml2B1AVB3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scml2B1AVB3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scml2B1AVB3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scml2B1AVB3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scml2B1AVB3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scml2B1AVB3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scml2B1AVB3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scml2B1AVB3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scml2B1AVB3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scml2B1AVB3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scml2B1AVB3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scml2B1AVB3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scml2B1AVB3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scml2B1AVB3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scml2B1AVB3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scml2B1AVB3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scml2B1AVB3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scml2B1AVB3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scml2B1AVB3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scml2B1AVB3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scml2B1AVB3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scml2B1AVB3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scml2B1AVB3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scml2B1AVB3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scml2B1AVB3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scml2B1AVB3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scml2B1AVB3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scml2B1AVB3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scml2B1AVB3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scml2B1AVB3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scml2B1AVB3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scml2B1AVB3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scml2B1AVB3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scml2B1AVB3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scml2B1AVB3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scml2B1AVB3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scml2B1AVB3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scml2B1AVB3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scml2B1AVB3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scml2B1AVB3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scml2B1AVB3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scml2B1AVB3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scml2B1AVB3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scml2B1AVB3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scml2B1AVB3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scml2B1AVB3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scml2B1AVB3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scml2B1AVB3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scml2B1AVB3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scml2B1AVB3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scml2B1AVB3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scml2B1AVB3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Scml2B1AVB3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scml2B1AVB3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scml2B1AVB3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scml2B1AVB3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scml2B1AVB3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scml2B1AVB3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms