Protein–RNA interactions for Protein: A8MTB9

CEACAM18, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM18A8MTB9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM18A8MTB9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM18A8MTB9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEACAM18A8MTB9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM18A8MTB9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEACAM18A8MTB9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEACAM18A8MTB9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM18A8MTB9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM18A8MTB9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM18A8MTB9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM18A8MTB9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM18A8MTB9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM18A8MTB9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM18A8MTB9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM18A8MTB9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM18A8MTB9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEACAM18A8MTB9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM18A8MTB9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM18A8MTB9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM18A8MTB9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEACAM18A8MTB9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM18A8MTB9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM18A8MTB9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM18A8MTB9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM18A8MTB9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM18A8MTB9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM18A8MTB9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM18A8MTB9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM18A8MTB9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM18A8MTB9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM18A8MTB9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM18A8MTB9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM18A8MTB9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM18A8MTB9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM18A8MTB9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM18A8MTB9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM18A8MTB9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM18A8MTB9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM18A8MTB9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM18A8MTB9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM18A8MTB9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM18A8MTB9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM18A8MTB9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM18A8MTB9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM18A8MTB9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM18A8MTB9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM18A8MTB9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM18A8MTB9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM18A8MTB9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms